Національний еколого-натуралістичний центр учнівської молоді особливу увагу приділяє підвищенню професійного рівня педагогів для роботи в інклюзивному освітньому середовищі спільно з Київським університетом ім. Б. Грінченка.

Проводиться ряд семінарів-практикумів, майстер-класів, тренінгів для педагогів-дефектологів, логопедів ДНЗ, вчителів корекційної освіти, вихователів спеціальних шкіл, що дає змогу ефективно поєднувати методики інклюзивної освіти з різними формами роботи з природним матеріалом. Надзвичайно яскравим прикладам застосування інклюзивної освіти є Школа народних ремесел НЕНЦ, на основі якої регулярно проводяться семінари та тренінги з практичними демонстраціями напрацювань школи.

26 січня 2015 р. працювала педагогічна майстерня вчителів-логопедів ДНЗ на тему «Використання арсеналу народної педагогіки у проведенні логопедичних занять» та «Особливості застосування знань природничо-екологічного циклу в заняттях вчителя-логопеда».