Навчання у Школі здійснювалося в наукових відділеннях за напрямами:
- – природничий (біологія, екологія, хімія);
- – декоративно-прикладний (народні ремесла, флористика та фітодизайн).
На осінню сесію 2015 року Природничої школи прибули учні 9, 10 і 11 класів з 10 областей України та м. Києва. Загалом – 61 вихованець. Урочисте відкриття Школи відбулось у Національному університеті “Києво-Могилянська академія”. Презентували вищий навчальних заклад декан біологічного факультету та завідувачі кафедр. Учні мали можливість оглянути наукові лабораторії університету.
Під час навчального процесу у всіх відділеннях проводились різноманітні форми навчально-виховної діяльності.
Для слухачів Школи були прочитані лекції, велись практичні заняття, майстер-класи, консультації з питань підготовки учнівських науково-дослідницьких робіт, виставки творчих робіт учнів.
Лекторами виступали науково-педагогічні працівники вищих навчальних закладів Києва та провідні науковці академічних установ.
Цікавими виявились практичні заняття з основ гідробіології, для учнів відділення біології, під керівництвом старшого наукового співробітника Інституту гідробіології НАН України, кандидата біологічних наук Білоус О.П. А слухачі відділення хімії мали змогу, під керівництвом доцента, кандидата хімічних Теребіленко К.В. виконувати практичні роботи на базі хімічного факультету Київського національного університету ім. Т. Шевченка.
Наприкінці осінньої сесії вихованці отримали тематичні завдання для виконання у міжсесійних період.